Con el comando rsync podemos limpiar nuestro proyecto de ficheros .svn (y cualquier otro que se desee) antes de su publicación. Para ello basta con teclear o crear un script con la siguiente orden:

rsync -avz --exclude '.svn' /ruta_proyecto_desarrollo/$1 /ruta_proyecto_limpio/

(*) $1 = directorio pasado como parámetro.-

En el siguiente enlace encontrarás algunos comandos para utilizar con SSH.